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環球關注:追溯癌癥的祖先 新軟件從腫瘤遺傳物質準確推斷血統

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日期:2023-01-03 17:33:41    來源:科技日報    


(資料圖片)

科技日報記者?張夢然

美國冷泉港實驗室研究人員正在努力揭示癌癥與種族/民族之間的家譜聯系。他們開發的新軟件,可從腫瘤DNA和RNA中準確推斷出血統。這些工作還可幫助臨床醫生制定早期癌癥檢測和個性化治療的新策略。研究成果近日發表在《癌癥研究》雜志上。

知道祖先來自哪里,會是更好的癌癥治療關鍵嗎?答案可能存在于包含數十萬份腫瘤樣本的龐大數據庫和醫院檔案中。

研究人員表示,為什么不同種族/民族的人對不同癌癥的患病率不同?可能是他們有不同的習慣、生活條件等各種社會和環境因素,但也可能有遺傳成分。

研究團隊使用混合DNA圖譜訓練其軟件工具,從已知背景的癌性和無癌癥基因組中創建這些圖譜。然后,他們測試了該軟件中已知血統患者的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌標本的性能。研究發現該軟件能以超過95%的準確率將創建的混合圖譜與種群相匹配。

研究團隊還加入了一項結直腸癌聯合研究。該研究使他們能夠探索結直腸癌如何根據特定種族/民族以不同的方式突變基因。他們希望進一步完善這一軟件,未來不僅推斷出整個基因組的祖先,還能推斷其中每個序列的祖先。

研究人員稱,如果能夠識別出更易患癌癥或其他侵入性疾病的祖先,軟件將可幫助確定基因組中負責癌癥的特定部分并進行靶向治療。“現在,一個簡單的DNA拭子可告訴你來自哪里,以及會遺傳哪些疾病。將來,它也可能給你打敗疾病的手段。”

癌癥與遺傳基因、生活習慣、生活環境等因素有著密切的關聯,這些因素都可以成為研究癌癥的重要線索。順藤摸瓜地沿著這些線索去探尋癌癥的起因,都很有可能找到對癌癥的預防或治療富有價值的信息:如果發現某些生活習慣或生活環境容易招致癌癥,我們就可以提前避而遠之;從遺傳基因的維度深究下去,則有助于從基因組中尋找對癌癥進行靶向治療的關鍵信息。

關鍵詞: 遺傳物質

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