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陳科
3月14日筆者從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，該校黃琳凱教授團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了首個(gè)美洲狼尾草圖形泛基因組，并揭示了狼尾草耐熱的分子機(jī)制，相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上。
美洲狼尾草，又名珍珠粟，全球種植面積約3100萬(wàn)公頃。在我國(guó)，它是一種重要飼草。在研究過(guò)程中，黃琳凱團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外多家單位，從全球8個(gè)地區(qū)收集的394份美洲狼尾草核心種質(zhì)中選取了10份代表性材料，將基因組從頭組裝，獲得了高質(zhì)量的基因組組裝序列，并結(jié)合已報(bào)道的基因組構(gòu)建了首個(gè)美洲狼尾草圖形泛基因組，共發(fā)掘424085個(gè)結(jié)構(gòu)變異。
同時(shí)，基于對(duì)泛基因組圖譜進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)了143個(gè)重要農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的變異位點(diǎn)，并挖掘到與產(chǎn)量性狀相關(guān)的候選基因446個(gè)。黃琳凱表示，與參考基因組相比，圖形泛基因組包含的遺傳信息更全面，通過(guò)發(fā)掘其中的結(jié)構(gòu)變異，能夠更好地解析植物表型和農(nóng)藝性狀的不同，為下一步育種奠定重要的研究基礎(chǔ)。“該項(xiàng)研究可加速攻關(guān)牧草業(yè)各環(huán)節(jié)‘卡脖子’技術(shù)，培育突破性牧草優(yōu)良品種，助力提升優(yōu)質(zhì)安全食物的供給保障能力，為國(guó)家糧食安全貢獻(xiàn)草業(yè)科研的力量。”她說(shuō)。
美洲狼尾草高質(zhì)量基因組組裝和泛基因組分析。受訪者供圖
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