近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團隊發(fā)布了獨龍牛高質(zhì)量全基因組組裝序列，揭示了獨龍牛的起源與系統(tǒng)地位問題、染色體融合的分子機制以及環(huán)境適應(yīng)性的遺傳基礎(chǔ)，對我國牛種質(zhì)資源的優(yōu)異種質(zhì)和基因的精準鑒定具有重要意義。相關(guān)研究成果發(fā)表在期刊《通訊生物》上。
獨龍牛又稱“大額牛”，主要分布于云南省獨龍江和怒江流域，是我國唯一的半野生半家養(yǎng)的珍稀牛種。我國的獨龍牛與東南亞及南亞國家的大額牛一樣，其起源與形成史在分類地位上尚有爭議。早期研究表明，普通牛2號、28號染色體的羅伯遜易位可能形成了獨龍牛的1號染色體，但缺乏基因組學(xué)層面的支持。因此，研究獨龍牛高質(zhì)量全基因組組裝序列，從而進行深入系統(tǒng)分析，成為了解開獨龍牛起源和演化歷史之謎的鑰匙。
科研人員利用二代、三代和10xGenomics等測序技術(shù)，成功獲得了獨龍牛高完整性和連續(xù)性的全基因組序列。通過比較基因組學(xué)分析，描繪了獨龍牛進化歷史，發(fā)現(xiàn)獨龍牛與牦牛、野牛一樣，在大約300萬年前的上新世晚期就從Bos牛屬中相繼發(fā)生分化，比家牛早了100多萬年，團隊從物種形成時間和遺傳關(guān)系分析，得出的結(jié)論支持了獨龍牛是獨立的牛屬物種的分類學(xué)地位。為全面精準評價獨龍牛種質(zhì)遺傳資源特性，科研人員通過多維度基因表達和生物途徑分析，整合了43個參與心血管循環(huán)進化的基因，發(fā)現(xiàn)獨龍牛已經(jīng)進化出物種特異性MYH基因家族成員，以滿足其高山峽谷的特定環(huán)境下心臟生理功能的需要。
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