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每日動(dòng)態(tài)!基因組數(shù)據(jù)與機(jī)器學(xué)習(xí)算法相結(jié)合,新方法可預(yù)測未來罹患白血病風(fēng)險(xiǎn)

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日期:2022-07-13 05:32:19    來源:科技日報(bào)    


(資料圖片僅供參考)

科技日報(bào)記者 劉霞

英國科學(xué)家在最新一期《自然·醫(yī)學(xué)》雜志上發(fā)表論文稱,他們可根據(jù)血細(xì)胞內(nèi)發(fā)生的突變,結(jié)合基因組數(shù)據(jù)與機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),預(yù)測某人未來罹患白血病的風(fēng)險(xiǎn)。

圖片說明:物理學(xué)家組織網(wǎng)

白血病通常是血細(xì)胞生產(chǎn)的精細(xì)平衡(新血細(xì)胞被制造出來,舊血細(xì)胞死亡)被破壞的結(jié)果。隨著年齡增長,血液干細(xì)胞會(huì)發(fā)生突變,這可能意味著改變后的細(xì)胞比其他血細(xì)胞更具生長優(yōu)勢,且在數(shù)量上超過其他血細(xì)胞,這就是所謂的適應(yīng)性優(yōu)勢。

英國愛丁堡大學(xué)和格拉斯哥大學(xué)研究人員調(diào)查了血液生產(chǎn)中發(fā)生的適應(yīng)性優(yōu)勢變化,以及如何根據(jù)這些突變預(yù)測某人未來罹患白血病的風(fēng)險(xiǎn)。

該研究負(fù)責(zé)人之一、愛丁堡大學(xué)塔米爾·錢德拉博士解釋道,他們測量了洛錫安區(qū)隊(duì)列(LBCs)中83名老年人血液樣本的變化。LBCs隊(duì)列是有關(guān)大腦、認(rèn)知和衰老的縱向研究項(xiàng)目,包括1921隊(duì)列和1936隊(duì)列,參與者如今已經(jīng)八九十歲,這些人在11歲時(shí)就參加了智力測試。

錢德拉等人每3年對1921隊(duì)列中70—82歲的個(gè)體、1936隊(duì)列中79—92歲的個(gè)體進(jìn)行一次隨訪,然后研究團(tuán)隊(duì)將這些復(fù)雜的基因組數(shù)據(jù)與機(jī)器學(xué)習(xí)算法相結(jié)合,將不同的突變與攜帶這些突變的造血干細(xì)胞的不同生長速度關(guān)聯(lián)起來。

研究發(fā)現(xiàn),在無白血病人群中,特定突變給血液干細(xì)胞帶來了明顯的適應(yīng)性優(yōu)勢。這可用來預(yù)測突變細(xì)胞的生長速度,從而決定實(shí)驗(yàn)對象罹患白血病的風(fēng)險(xiǎn)。不過,研究團(tuán)隊(duì)也表示,由于當(dāng)前研究樣本數(shù)量有限,還需要進(jìn)一步在更大群體中驗(yàn)證這些結(jié)果。

該研究聯(lián)合負(fù)責(zé)人、格拉斯哥大學(xué)癌癥科學(xué)研究所的克里斯蒂娜·克什納博士說:“在了解某個(gè)患者有罹患白血病的風(fēng)險(xiǎn)后,臨床醫(yī)生可縮短最有可能罹患白血病的患者的預(yù)約間隔,盡早開展治療。”

關(guān)鍵詞: 預(yù)測未來 機(jī)器學(xué)習(xí)

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