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          近3300種動物的基因組已被測序 動物全物種基因組測序“顧此失彼”

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          日期:2021-12-08 16:45:46    來源:中國科學報    

          近日,美國華盛頓州立大學領導的一項研究發現,目前對動物基因組進行的測序多數集中在與人類相似的動物上。研究人員警告稱,這會使人們忽視生物多樣性和錯失機會。相關成果發表于美國《國家科學院院刊》。

          研究人員分析發現,近3300種動物的基因組已被測序。然而,與世界上166萬種動物物種相比,這一數字還是很少,脊椎動物在目前的序列中占了絕大部分。數據顯示,盡管脊椎動物只代表了3.9%的動物物種,但卻占測序數據集的54%。相比之下,代表78.5%物種的節肢動物門無脊椎動物,只占當前數據集的34%。

          “隨著基因組數據集的迅速積累,我們會發現,目前數據集并不是均勻分布在動物生命樹中。”研究作者、華盛頓州立大學博士后研究員Scott Hotaling認為,無脊椎動物仍然非常缺乏相關研究,因為人們似乎更關心脊椎動物。

          研究通訊作者、美國楊百翰大學助理教授Paul Frandsen表示,要了解整個生態系統,必須對更多的生物進行采樣。脊椎動物是生態系統的重要組成部分,但昆蟲和許多其他小型生物可能發揮著更重要的作用,因為它們處于食物鏈的底端。

          研究作者、華盛頓州立大學副教授Joanna Kelley還指出,目前絕大多數基因測序工作在發達國家開展,且大多數國家位于北半球,不同地區的測序工作也有特定的傾向。例如,北美國家對哺乳動物和昆蟲進行了較多測序,歐洲國家、亞洲國家分別對魚類和鳥類進行了較多測序。

          近年來,幾項大型的基因組測序工作啟動,其中包括地球生物基因組計劃。該計劃設定了一個雄心勃勃的目標,在未來10年內對所有真核生物進行測序。

          截至2021年6月,該計劃已收集到3300多個動物基因組數據集。研究人員通過計算發現,以目前每天大約測序4個基因組的速度,要到3130年才能實現對所有真核生物進行測序的目標。

          研究人員同時提出,促進該目標實現的一個方法是發展基礎設施,并讓更多來自南半球的國家,尤其是動物多樣性豐富的熱帶地區的研究人員參與其中。(辛雨)

          關鍵詞: 動物全物種基因組測序 動物基因組 脊椎動物 節肢動物

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